发展与印尼的合作关系经贸往来和文化交流应该成为主渠道。要充分运用中国－东盟自由贸易区的平台，加大经贸往来的力度。从总体上东盟已取代日本，成为我国第三大贸易伙伴，但我国与印尼的贸易似还不尽如人意，还大有潜力可挖，要通过政府和企业界的共同努力，把中印经贸关系发展到一个新的高度。同时应开展多种多样的文化交流，增强两国人民对双方文化的了解，这方面过去也比较薄弱，大有加强的必要。

发展与印尼的合作还可以有选择有步骤地开展两军间的交流。可以先在合作打击恐怖主义、打击海盗、抢险救灾等方面进行合适规模的联合演习，增进两军间的相互了解和友谊。

总之，东盟是我国在东南方向的近邻，要创造一个良好的周边环境，东盟不可或缺。在某些东南亚国家觊觎我岛礁和海洋资源并在短期内尚难解决的形势下，大力发展与印尼等有关东盟国家的关系，对于化解南海危机，是大有益处的。